Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms