Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nphp3Q7TNH6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nphp3Q7TNH6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nphp3Q7TNH6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nphp3Q7TNH6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nphp3Q7TNH6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nphp3Q7TNH6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp3Q7TNH6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms