Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbno2Q7TNB8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms