Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms