Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms