Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms