Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt9Q6RHW0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms