Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Arhgap20Q6IFT4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms