Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6DFW0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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