Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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