Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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