Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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