Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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