Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama3Q61789 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama3Q61789 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama3Q61789 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama3Q61789 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama3Q61789 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms