Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms