Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik1Q60934 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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