Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms