Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms