Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim41Q5NCC3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms