Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms