Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al1nQ497L1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms