Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc114Q3UX62 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc114Q3UX62 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms