Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Skap2Q3UND0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Skap2Q3UND0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Skap2Q3UND0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Skap2Q3UND0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms