Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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