Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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