Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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