Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms