Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nlrx1Q3TL44 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrx1Q3TL44 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms