Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms