Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cul4aQ3TCH7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cul4aQ3TCH7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms