Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd11Q1RNF8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms