Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms