Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms