Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NeblQ0II04 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NeblQ0II04 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NeblQ0II04 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NeblQ0II04 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms