Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf541Q0GGX2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms