Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms