Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms