Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms