Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Apoc2Q05020 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apoc2Q05020 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms