Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox10Q04888 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms