Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms