Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RykQ01887 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RykQ01887 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RykQ01887 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RykQ01887 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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