Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelpQ01102 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SelpQ01102 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms