Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nbr1P97432 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms