Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms