Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbdsP70122 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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