Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp2P63044 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms