Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gnb1P62874 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gnb1P62874 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms