Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CirbpP60824 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CirbpP60824 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms