Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms